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正交设计优化芒果SRA—CR反应体系及引物筛选(2)

时间:2015-04-03 12:23 点击:
根据上述试验的优化结果,随机选取Me6与Em引物组合来对0份芒果种质的DNA进行扩增,以进一步验证该扩增反应体系的效果。由图3可以看出,引物Me6与Em不但对0份芒果种质均能扩增出较好的条带,而且也存在着很明显[CM(
  根据上述试验的优化结果,随机选取Me6与Em引物组合来对0份芒果种质的DNA进行扩增,以进一步验证该扩增反应体系的效果。由图3可以看出,引物Me6与Em不但对0份芒果种质均能扩增出较好的条带,而且也存在着很明显[CM(25]的多态性条带,由此说明所优化的扩增体系比较可靠,适合芒果种质的SRA分析研究。 
  3结论与讨论 
  CR反应体系的优化方法主要有3种:单因素试验、均匀试验和正交试验优化。正交试验设计相对单因素试验而言具有试验次数较少、效用明确且能较快地获得极佳的试验结果的特点,避免了单一因素试验结果的不足。目前,正交试验设计已成功应用于枣、价廉草、花生、番石榴等植物的 SRA-CR 反应体系优化[7],但在芒果上还未曾见报道。本试验通过正交设计,对影响芒果SRA 反应体系的模板DNA含量、引物浓度、2×Taq CR Master Mix含量进行了优化,建立了适用于芒果的最优SRA反应体系,即25μL反应体系中包含30 ng 模板DNA、03μmol/L 引物、0μL 2×Taq CR Master Mix。同时,在00个引物组合中,共得到多态性引物组合36个。该反应体系及36个多态性引物组合可用于芒果种质遗传多样性分析、系统发育和育种应用等方面,同时也为芒果品种鉴定、亲缘关系分析及优良新品种的选育等提供技术参考。 
  影响SRA-CR反应的因素相对复杂,不同植物适应的SRA 反应体系不同,且各因素之间存在着相互效应,只有各因子之间的浓度配比达到最佳状态时才能得到稳定、可重复的扩增结果。因此,SRA标记应用到不同物种上时需要优化反应体系和条件。在芒果SRA 体系优化的过程中,发现DNA模板含量、2×Taq CR Master Mix含量及引物浓度等均会影响SRA扩增效果,但模板DNA含量对扩增无明显影响(20~60 ng 之间均有稳定的扩增),这与其他学者的研究结果相似[2,8-0]。可见,对芒果SRA 反应条件进行优化是非常必要的。 
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