近年来，水利水电工程环境影响评价已经考虑到对生态系统的影响，涉及到部分生物多样性影响分析的内容，主要集中在水库蓄水、河流受阻和清水下泄造成的近岸植物、水草、浮游生物、鱼类等物种多样性层面的影响评价，尤其是对珍稀鱼类的生长、繁殖、洄游等的影响进行了详细评估。

　　这些工作虽然取得了一定的成果，但是对于水利水电工程建设可能导致的生物多样性影响问题识别，特别是科学、客观地开展水利水电工程中的生物多样性影响评价来说是远远不够的。水利水电工程环境影响评价中所开展的针对生态环境影响的评价内容及其存在问题表现以下方面：

　　（1）目前的水利水电工程环评大多只关注了物种多样性层面的影响，对于基因多样性、生态系统多样性及景观多样性层面较少涉及；

　　（2）水生生物大部分集中于对珍稀鱼类的影响评价，较少涉及其它水生生物物种；

　　（3）针对陆生生物的影响评价，往往侧重具体或单一物种及栖息地的保护（如对保护鸟类的问题），没有考虑物种生活史尤其是繁殖遗传受到的系统影响和保护问题；

　　（4）很少考虑对非珍稀保护动植物以及非自然保护区生物多样性的影响；

　　（5）没有考虑对工程影响范围内的生物多样性资源进行监测和评估，对工程的间接影响、长期影响的定量预测评价工作没有全面开展。

　　综合以上几点，亟待于对目前的水利水电工程环境影响评价要素进行补充，将生物多样性影响纳入到其评价范畴，利于在水利水电工程环境影响评价中更加重视对生物多样性的影响问题，科学、客观分析评价水利水电工程对生物多样性的影响。

　　水利水电工程环境影响评价中的生物多样性影响评价如何将生物多样性影响评价纳入到水利水电工程的环境影响评价中是一个新兴的课题，亟待从以下方面进行评价：

　　（1）深入开展工程影响区的生物多样性调查与评价。普查生物种群数量、分布状况、濒危物种状况、代表性、原有保护措施及存在问题等等；开展生物多样性评价，根据流域生物多样性特性和社会经济状况确定是否有必要保护生物多样性及其需要采取的措施等。

　　（2）重视关注生境变化对生物多样性的影响。工程对生物的影响大多是通过直接改变生境而间接影响生物多样性，尤其是水利工程产生的水土资源开发模式变化引发生态变化、水动力学条件和水文情势变化及水土资源时空改变对河流生境和流域重要栖息地的影响。因此，关注生境的变化可以及时预测生物多样性的改变，同时应尽量保持河道的自然特点及水流的多样性，各项工程建设时尽量保持沿河湿地、沼泽地的水源补给，以及有序地保留水、陆连续通道，为各类水生物及两栖生物提供觅食、栖息和繁衍的空间。

　　（3）以影响途径分析为主链，评价除了珍稀鱼类以外的水生生物的影响，注意“top-down”效应。淡水生态系统中高营养级类群可以对低营养级类群产生强烈的影响，最终导致整个生态环境的改变，这一现象被称作下行（top-down）效应。Top-down效应还表现在当原来生态系统中的高营养级类群缺少时，也会造成生态系统结构与功能发生变化。因此，在淡水生态系统的生物多样性保护中，应注意高营养级类群的保护。

　　（4）从工程施工和正常运行两个阶段来评价项目对陆生动植物的影响。施工期对陆生生物多样性的影响主要是铺路、开挖和弃渣对植被的破坏及噪声对动物栖息地的影响；正常运行阶段对植物的影响主要是淹没及沼泽化，对动物的影响大多是间接的，通过对生境及其捕食植物的影响而作用于动物。

　　（5）定量预测水利水电工程导致的生物多样性损失。采用定量评价方法量化生物多样性损失的大小，亦可预测工程建设带来的生物多样性减少的货币价值，据此与工程运行的经济效益相比较以供决策。

　　（6）保护生态系统完整性。由于人力活动的干扰，生物生存的空间越来越小逐渐成为一个个“孤岛”。该种生态环境下生长的生物近亲繁殖，导致逐步退化直至消亡，因此保持生态系统完整性是保护生物多样性的重要方面。水利水电工程修建过程中，需要构建“生物廊道”、“生物岛屿”，保障上游与下游、陆地与水域间的水力联系，保障河流系统中生物通道的联通性。

　　（7）提出针对性保护对策。坚持以就地保护为主，迁地保护为辅，两者相互补充。陆生动物保护：对于淹没线以上陆生动物的保护，关键是保护现有的自然植被，保护其原有生境；对于生活在水库淹没线以下的陆生动物，在库区附近非淹没区选择相似的新栖息地，规划好迁移通道，在蓄水前实施迁移保护。陆生植物保护：依次选择就地保护、移植保护、异地重建等措施。水生动物和鱼类保护：建立自然保护区、设置过鱼设施、人工增殖放流、采用生态调度方式等。

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